9月，我院簡茂球教授、熊亞教授、管東生教授、劉偉副教授、湯葉濤講師、張轶男講師、杜長明講師和彭逸生博士等八人獲得2009年度國家基金資助項目。
9月3日，院行政機構正式搬遷至東校區北學院樓B座辦公。
9月4日至9日，學院迎新籌備系列工作展開。
9月9日晚，新生報到結束後，學院黨委楊建林書記、曾令初副院長、甘遠璠副書記和各年級輔導員老師前往宿舍看望09級新生。
9月11日下午，學院召開迎新大會，會後楊建林書記主講新生教育第一講《校史、院史介紹》。随後，各系召開情況介紹會與班主任見面會。各系教師于當晚走訪新生宿舍。
9月12日，學院召開新生第一次年級大會，會後由08級環境工程1班主講新生教育第二講《大學生活指引》
9月13日，08級大氣科學班主講新生教育第三講《安全教育和防艾教育》。随後，學院副院長簡茂球教授為新生介紹學籍管理方面的各項要求。
9月14日，Professor Jeffrey L.Collett（Department of Atmospheric Science，Colorado State University U.S.A）在東校區為我院師生作了題為“Pollution Processing by Cloud”的報告。
9月16日，召開了院分工會委員、部門工會主席聯席會議，會上由曾令初主席總結了工會2009年上半年的工作，進一步明确了下半年要做的工作。會議決定，學院新成立的二級單位均設立部門工會。
9月17日下午，曹龍博士（Department of Global Ecology, Carnegie Institution, Stanford, CA, U.S.A）在南校區為我院師生作了題為“Environmental consequence of increasing atmospheric CO2: beyond the greenhouse warming”的報告。
9月18日起，我院本年度獎助學金評定工作正式展開，各項獎助學金陸續接受申請。
9月22日下午，林穗文博士（Nichias Corp. 總部 省能源環境技術開發部）在東校區為我院師生作了題為“節能及環境淨化納米機能材料的研究”的學術報告
9月25日，院學生會在學生活動中心成功舉辦了主題為“緣來9是你”的迎新晚會。
9月27日下午，學院教師聘任委員會召開會議，重點讨論了百人計劃引進人才和環科所教師聘期考核評估标準與實施方案。
9月27日下午，學院黨政聯席會召開會議，重點研究了實驗室人員聘任和實驗中心建設等議題。
9月30日，由曾令初副院長組織召開了地環大樓治安、消防管理小組成員工作會議，與會人員就如何加強和完善地環大樓的治安、消防管理工作進行認真的讨論和總結，并按規定将輪值管理權移交地球科學系。
